Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDLBPQ00341 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HDLBPQ00341 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms