Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms