Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P63132 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P63132 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms