Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX17P56962 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX17P56962 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX17P56962 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX17P56962 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX17P56962 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX17P56962 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX17P56962 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX17P56962 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX17P56962 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX17P56962 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX17P56962 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX17P56962 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX17P56962 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STX17P56962 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
STX17P56962 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
STX17P56962 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX17P56962 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX17P56962 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX17P56962 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX17P56962 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX17P56962 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STX17P56962 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX17P56962 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX17P56962 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
STX17P56962 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX17P56962 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX17P56962 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX17P56962 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX17P56962 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX17P56962 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX17P56962 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX17P56962 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms