Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSMD4P55036 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD4P55036 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms