Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRX1P54821 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms