Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARSP54136 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RARSP54136 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARSP54136 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARSP54136 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARSP54136 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RARSP54136 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RARSP54136 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RARSP54136 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RARSP54136 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RARSP54136 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RARSP54136 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARSP54136 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARSP54136 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARSP54136 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RARSP54136 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RARSP54136 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RARSP54136 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RARSP54136 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RARSP54136 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RARSP54136 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARSP54136 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARSP54136 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARSP54136 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARSP54136 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARSP54136 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARSP54136 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARSP54136 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RARSP54136 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARSP54136 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARSP54136 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARSP54136 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARSP54136 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARSP54136 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARSP54136 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARSP54136 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARSP54136 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARSP54136 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RARSP54136 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RARSP54136 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RARSP54136 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARSP54136 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARSP54136 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARSP54136 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARSP54136 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARSP54136 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARSP54136 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RARSP54136 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARSP54136 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARSP54136 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARSP54136 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARSP54136 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARSP54136 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARSP54136 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RARSP54136 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RARSP54136 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RARSP54136 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RARSP54136 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RARSP54136 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RARSP54136 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RARSP54136 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RARSP54136 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RARSP54136 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARSP54136 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARSP54136 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARSP54136 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARSP54136 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARSP54136 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARSP54136 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARSP54136 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARSP54136 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARSP54136 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARSP54136 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARSP54136 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARSP54136 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RARSP54136 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARSP54136 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARSP54136 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARSP54136 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms