Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms