Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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