Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOSBP53539 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOSBP53539 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOSBP53539 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOSBP53539 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOSBP53539 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOSBP53539 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOSBP53539 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOSBP53539 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FOSBP53539 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOSBP53539 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOSBP53539 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOSBP53539 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOSBP53539 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOSBP53539 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOSBP53539 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOSBP53539 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOSBP53539 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
FOSBP53539 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOSBP53539 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOSBP53539 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOSBP53539 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOSBP53539 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOSBP53539 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOSBP53539 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOSBP53539 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FOSBP53539 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOSBP53539 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOSBP53539 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOSBP53539 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOSBP53539 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOSBP53539 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOSBP53539 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOSBP53539 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms