Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST1P52848 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST1P52848 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST1P52848 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST1P52848 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST1P52848 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST1P52848 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST1P52848 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST1P52848 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST1P52848 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST1P52848 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST1P52848 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST1P52848 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST1P52848 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST1P52848 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST1P52848 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST1P52848 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST1P52848 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST1P52848 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST1P52848 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST1P52848 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST1P52848 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST1P52848 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST1P52848 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST1P52848 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST1P52848 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDST1P52848 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDST1P52848 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDST1P52848 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST1P52848 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST1P52848 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST1P52848 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST1P52848 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST1P52848 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST1P52848 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST1P52848 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST1P52848 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST1P52848 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms