Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2A2P52657 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms