Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC34P49427 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC34P49427 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC34P49427 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC34P49427 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC34P49427 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC34P49427 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC34P49427 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC34P49427 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC34P49427 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC34P49427 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC34P49427 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC34P49427 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC34P49427 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDC34P49427 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC34P49427 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC34P49427 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC34P49427 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC34P49427 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC34P49427 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC34P49427 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDC34P49427 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC34P49427 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC34P49427 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC34P49427 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC34P49427 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDC34P49427 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms