Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms