Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms