Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LSSP48449 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LSSP48449 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LSSP48449 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSSP48449 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSSP48449 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSSP48449 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSSP48449 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSSP48449 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSSP48449 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LSSP48449 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSSP48449 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSSP48449 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSSP48449 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSSP48449 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSSP48449 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSSP48449 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSSP48449 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSSP48449 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSSP48449 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSSP48449 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSSP48449 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSSP48449 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSSP48449 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSSP48449 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSSP48449 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LSSP48449 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSSP48449 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LSSP48449 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSSP48449 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSSP48449 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSSP48449 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSSP48449 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSSP48449 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSSP48449 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LSSP48449 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSSP48449 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSSP48449 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms