Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSFP46459 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSFP46459 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSFP46459 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NSFP46459 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NSFP46459 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSFP46459 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSFP46459 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSFP46459 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSFP46459 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSFP46459 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSFP46459 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSFP46459 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSFP46459 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSFP46459 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSFP46459 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSFP46459 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSFP46459 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSFP46459 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSFP46459 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSFP46459 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSFP46459 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSFP46459 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSFP46459 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSFP46459 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSFP46459 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSFP46459 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSFP46459 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NSFP46459 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSFP46459 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSFP46459 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSFP46459 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NSFP46459 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSFP46459 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSFP46459 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NSFP46459 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NSFP46459 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSFP46459 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSFP46459 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSFP46459 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSFP46459 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSFP46459 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSFP46459 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSFP46459 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSFP46459 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSFP46459 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSFP46459 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSFP46459 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSFP46459 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSFP46459 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NSFP46459 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NSFP46459 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSFP46459 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSFP46459 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSFP46459 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NSFP46459 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSFP46459 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms