Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms