Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF4P43489 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms