Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA1P43355 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms