Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAA2P42765 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms