Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCIP41743 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCIP41743 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms