Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH1P40925 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH1P40925 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH1P40925 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH1P40925 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDH1P40925 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH1P40925 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH1P40925 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH1P40925 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH1P40925 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH1P40925 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH1P40925 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH1P40925 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH1P40925 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDH1P40925 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDH1P40925 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDH1P40925 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDH1P40925 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDH1P40925 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDH1P40925 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDH1P40925 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH1P40925 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH1P40925 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH1P40925 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH1P40925 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH1P40925 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH1P40925 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH1P40925 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH1P40925 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDH1P40925 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH1P40925 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH1P40925 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH1P40925 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH1P40925 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH1P40925 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH1P40925 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDH1P40925 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDH1P40925 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms