Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCAP37840 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCAP37840 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCAP37840 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCAP37840 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNCAP37840 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNCAP37840 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNCAP37840 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCAP37840 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCAP37840 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms