Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RFC4P35249 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFC4P35249 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFC4P35249 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC4P35249 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC4P35249 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC4P35249 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC4P35249 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC4P35249 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC4P35249 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC4P35249 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC4P35249 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC4P35249 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RFC4P35249 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC4P35249 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC4P35249 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC4P35249 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC4P35249 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC4P35249 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC4P35249 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC4P35249 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC4P35249 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC4P35249 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC4P35249 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC4P35249 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC4P35249 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC4P35249 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC4P35249 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC4P35249 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC4P35249 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC4P35249 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC4P35249 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC4P35249 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC4P35249 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC4P35249 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC4P35249 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC4P35249 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC4P35249 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC4P35249 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC4P35249 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC4P35249 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC4P35249 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC4P35249 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC4P35249 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC4P35249 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC4P35249 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RFC4P35249 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFC4P35249 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFC4P35249 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFC4P35249 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFC4P35249 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFC4P35249 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFC4P35249 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFC4P35249 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RFC4P35249 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RFC4P35249 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFC4P35249 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RFC4P35249 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RFC4P35249 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFC4P35249 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RFC4P35249 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFC4P35249 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFC4P35249 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFC4P35249 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFC4P35249 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RFC4P35249 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFC4P35249 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms