Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF2P35227 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF2P35227 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCGF2P35227 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCGF2P35227 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms