Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCKARP32238 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCKARP32238 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCKARP32238 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCKARP32238 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCKARP32238 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCKARP32238 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCKARP32238 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCKARP32238 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCKARP32238 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCKARP32238 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCKARP32238 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCKARP32238 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCKARP32238 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCKARP32238 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCKARP32238 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCKARP32238 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCKARP32238 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCKARP32238 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCKARP32238 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCKARP32238 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCKARP32238 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCKARP32238 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCKARP32238 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCKARP32238 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCKARP32238 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCKARP32238 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCKARP32238 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCKARP32238 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCKARP32238 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCKARP32238 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCKARP32238 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCKARP32238 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCKARP32238 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCKARP32238 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms