Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms