Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA7P31268 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA7P31268 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms