Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCKSP29966 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms