Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
KDM5AP29375 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
KDM5AP29375 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
KDM5AP29375 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
KDM5AP29375 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
KDM5AP29375 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms