Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HMGB2P26583 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms