Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT1P26572 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT1P26572 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT1P26572 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms