Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms