Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms