Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRGP23470 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRGP23470 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
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