Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KB1P23443 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KB1P23443 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms