Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL17P18621 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL17P18621 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL17P18621 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL17P18621 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL17P18621 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL17P18621 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL17P18621 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL17P18621 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL17P18621 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL17P18621 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL17P18621 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL17P18621 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL17P18621 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL17P18621 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL17P18621 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL17P18621 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL17P18621 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL17P18621 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL17P18621 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL17P18621 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL17P18621 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL17P18621 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL17P18621 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL17P18621 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL17P18621 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL17P18621 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL17P18621 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL17P18621 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL17P18621 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL17P18621 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL17P18621 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL17P18621 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL17P18621 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL17P18621 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL17P18621 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL17P18621 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL17P18621 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL17P18621 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL17P18621 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL17P18621 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL17P18621 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL17P18621 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL17P18621 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL17P18621 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL17P18621 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL17P18621 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL17P18621 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL17P18621 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL17P18621 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL17P18621 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms