Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB3P16520 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB3P16520 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB3P16520 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB3P16520 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB3P16520 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB3P16520 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB3P16520 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB3P16520 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB3P16520 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB3P16520 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB3P16520 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB3P16520 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB3P16520 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB3P16520 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB3P16520 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB3P16520 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB3P16520 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GNB3P16520 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB3P16520 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB3P16520 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB3P16520 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB3P16520 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB3P16520 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB3P16520 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB3P16520 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB3P16520 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB3P16520 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB3P16520 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB3P16520 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms