Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL11A1P12107 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms