Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFHP12036 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFHP12036 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFHP12036 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFHP12036 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFHP12036 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFHP12036 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEFHP12036 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEFHP12036 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFHP12036 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFHP12036 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEFHP12036 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFHP12036 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFHP12036 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFHP12036 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFHP12036 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFHP12036 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFHP12036 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFHP12036 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFHP12036 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFHP12036 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFHP12036 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFHP12036 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFHP12036 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFHP12036 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEFHP12036 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFHP12036 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFHP12036 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFHP12036 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFHP12036 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFHP12036 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFHP12036 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms