Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN8OSP0DMR3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATXN8OSP0DMR3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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