Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT7P08729 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT7P08729 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT7P08729 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT7P08729 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT7P08729 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT7P08729 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT7P08729 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT7P08729 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT7P08729 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT7P08729 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT7P08729 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT7P08729 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT7P08729 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT7P08729 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT7P08729 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT7P08729 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT7P08729 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT7P08729 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT7P08729 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT7P08729 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT7P08729 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT7P08729 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT7P08729 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT7P08729 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT7P08729 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT7P08729 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT7P08729 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT7P08729 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT7P08729 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT7P08729 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT7P08729 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms