Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS17P08708 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS17P08708 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS17P08708 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS17P08708 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS17P08708 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS17P08708 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS17P08708 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS17P08708 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS17P08708 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS17P08708 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPS17P08708 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS17P08708 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS17P08708 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS17P08708 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS17P08708 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS17P08708 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS17P08708 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS17P08708 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS17P08708 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS17P08708 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS17P08708 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS17P08708 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS17P08708 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS17P08708 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS17P08708 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS17P08708 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS17P08708 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS17P08708 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS17P08708 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS17P08708 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS17P08708 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS17P08708 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS17P08708 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS17P08708 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS17P08708 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS17P08708 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS17P08708 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS17P08708 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS17P08708 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms