Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB1P05556 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB1P05556 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms