Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP4O95707 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP4O95707 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POP4O95707 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP4O95707 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP4O95707 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP4O95707 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POP4O95707 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP4O95707 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POP4O95707 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP4O95707 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP4O95707 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP4O95707 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP4O95707 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP4O95707 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP4O95707 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP4O95707 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP4O95707 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP4O95707 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP4O95707 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP4O95707 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP4O95707 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POP4O95707 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP4O95707 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP4O95707 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP4O95707 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP4O95707 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP4O95707 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP4O95707 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP4O95707 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POP4O95707 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POP4O95707 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms