Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24AO95486 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms