Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRPM2O94759 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TRPM2O94759 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRPM2O94759 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms