Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH4O75427 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms