Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REV3LO60673 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REV3LO60673 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
REV3LO60673 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REV3LO60673 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REV3LO60673 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
REV3LO60673 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REV3LO60673 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REV3LO60673 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REV3LO60673 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
REV3LO60673 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REV3LO60673 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REV3LO60673 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REV3LO60673 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REV3LO60673 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
REV3LO60673 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REV3LO60673 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REV3LO60673 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REV3LO60673 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
REV3LO60673 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REV3LO60673 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REV3LO60673 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REV3LO60673 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REV3LO60673 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REV3LO60673 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
REV3LO60673 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REV3LO60673 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
REV3LO60673 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REV3LO60673 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REV3LO60673 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REV3LO60673 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REV3LO60673 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REV3LO60673 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REV3LO60673 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
REV3LO60673 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
REV3LO60673 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REV3LO60673 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REV3LO60673 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
REV3LO60673 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
REV3LO60673 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REV3LO60673 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
REV3LO60673 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REV3LO60673 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REV3LO60673 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REV3LO60673 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REV3LO60673 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
REV3LO60673 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REV3LO60673 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REV3LO60673 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REV3LO60673 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REV3LO60673 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REV3LO60673 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REV3LO60673 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REV3LO60673 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REV3LO60673 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REV3LO60673 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
REV3LO60673 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REV3LO60673 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REV3LO60673 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
REV3LO60673 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
REV3LO60673 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REV3LO60673 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REV3LO60673 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
REV3LO60673 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REV3LO60673 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REV3LO60673 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REV3LO60673 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REV3LO60673 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REV3LO60673 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REV3LO60673 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REV3LO60673 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REV3LO60673 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms